王晓宇^1,2* , 张洪雨^1,2 , 刘栩铭^1,2 , 孟迪^1,2 , 苑伟鹏¹ , 霍红雁^1,2 , 于丽丽¹ , 张继星^1,2*

1内蒙古民族大学生命科学与食品学院,通辽, 028000; 2内蒙古民族大学,科尔沁植物逆境生物学研究所,通辽, 028000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2021年07月06日    接受日期: 2021年07月19日    发表日期: 2021年12月21日

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环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins, CNGCs)是介导低价阳离子转运的重要蛋白，在植物信号传递、生长发育与非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。本研究利用序列比对法在蓖麻基因组水平进行 CNGC家族成员鉴定；利用生物信息学手段对蓖麻 CNGC家族成员的基因结构、保守基序、特征结构域、聚类方式、顺式作用元件及染色体定位信息进行分析。研究成功鉴定到 17个蓖麻 CNGC基因家族成员，定位于 16个未完整拼接的染色体片段上；除 RcCNGC13外，其他蛋白序列均包含高度保守的环核苷酸结合结构域 CNBD，但 RcCNGC4RcCNGC6RcCNGC13RcCNGC14均存在明显的基序缺失；部分RcCNGCs 启动子区均含有 MYB、MYC与 ABRE、ARE元件，推测其响应逆境胁迫。聚类分析将蓖麻 CNGC成员分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ组，推测不同类型 CNGC蛋白存在功能差异。转录组数据分析发现仅有RcCNGC14 受冷胁迫显著上调表达，暗示该基因参与调控蓖麻的冷适应性。本研究首次在蓖麻全基因组水平对 CNGC基因家族进行鉴定，并分析其冷胁迫下的表达模式，为进一步创制蓖麻抗冷新种质提供重要的候选基因。

蓖麻；CNGC基因家族；冷胁迫；表达模式